Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Fam178bQ24JP3 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Fam178bQ24JP3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fam178bQ24JP3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms