Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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Shroom4Q1W617 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Shroom4Q1W617 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Shroom4Q1W617 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms