Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd11Q1RNF8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Samd11Q1RNF8 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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