Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim71Q1PSW8 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trim71Q1PSW8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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