Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rpusd2Q149F1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Rpusd2Q149F1 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Rpusd2Q149F1 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rpusd2Q149F1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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