Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Spatc1Q148B6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms