Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ttc39dQ0VF76 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39dQ0VF76 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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