Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Itgb8Q0VBD0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Itgb8Q0VBD0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms