Protein–RNA interactions for Protein: Q0P557

Spata18, Mitochondria-eating protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spata18Q0P557 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Spata18Q0P557 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Spata18Q0P557 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms