Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

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Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ttc21bQ0HA38 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Ttc21bQ0HA38 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms