Protein–RNA interactions for Protein: Q08EE8

1700061G19Rik, RIKEN cDNA 1700061G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700061G19RikQ08EE8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
1700061G19RikQ08EE8 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
1700061G19RikQ08EE8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms