Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Siah1bQ06985 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Siah1bQ06985 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms