Protein–RNA interactions for Protein: Q05909

Ptprg, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprgQ05909 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PtprgQ05909 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PtprgQ05909 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms