Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC164597.2-201ENSMUST00000226738 603 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sox12Q04890 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ppp1r2-ps9-202ENSMUST00000173852 882 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Vmn1r89-206ENSMUST00000227319 985 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Anxa10-202ENSMUST00000034054 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Elk3-204ENSMUST00000151153 1336 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Olfr1449-204ENSMUST00000215325 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 AC165260.4-201ENSMUST00000225924 724 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm28360-201ENSMUST00000187455 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sox12Q04890 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms