Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sox8Q04886 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sox8Q04886 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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