Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms