Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Ddr1Q03146 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ddr1Q03146 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddr1Q03146 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddr1Q03146 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ddr1Q03146 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ddr1Q03146 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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