Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fgfr4Q03142 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms