Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cacna1sQ02789 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cacna1sQ02789 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms