Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snai1Q02085 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms