Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxd1Q01822 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms