Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cacna1cQ01815 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cacna1cQ01815 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms