Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EgfrQ01279 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms