Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbp4Q00724 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms