Protein–RNA interactions for Protein: P98195

Atp9b, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, mousemouse

Predictions only

Length 1,146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp9bP98195 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp9bP98195 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp9bP98195 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms