Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pitx2P97474 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms