Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Bop1P97452 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Bop1P97452 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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