Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Taf1bP97358 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms