Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Mesp1P97309 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
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Mesp1P97309 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Mesp1P97309 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Mesp1P97309 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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Mesp1P97309 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Mesp1P97309 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
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Mesp1P97309 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Mesp1P97309 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
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