Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gabpb2P81069 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gabpb2P81069 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms