Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
NficP70255 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
NficP70255 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
NficP70255 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms