Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SbdsP70122 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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