Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Rpl39P62892 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Rpl39P62892 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms