Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Rps29P62274 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms