Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Usp46P62069 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm45574-201ENSMUST00000210921 331 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Usp46P62069 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms