Protein–RNA interactions for Protein: P61092

Siah1a, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1A, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1aP61092 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Siah1aP61092 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms