Protein–RNA interactions for Protein: P61014

Pln, Cardiac phospholamban, mousemouse

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PlnP61014 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PlnP61014 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PlnP61014 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms