Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Csrnp3P59055 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Csrnp3P59055 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms