Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhbdl3P58873 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhbdl3P58873 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms