Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tpm2P58774 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tpm2P58774 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms