Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Samsn1P57725 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms