Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Bace1P56818 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Bace1P56818 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms