Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Irf5P56477 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Irf5P56477 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Irf5P56477 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms