Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nub1P54729 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Nub1P54729 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Nub1P54729 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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