Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ube2e3P52483 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ube2e3P52483 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms