Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
ClgnP52194 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms