Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hoxc13P50207 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hoxc13P50207 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Hoxc13P50207 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms