Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
BckdhaP50136 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms