Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CtshP49935 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CtshP49935 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CtshP49935 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms