Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmod1P49813 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmod1P49813 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms